تنقسم هذه المكتبة إلى قسمين:
القسم الأول: يحتوي على مختارات من مخطوطات آل عتيق البكري الصديقي القرشي (عقب عيسى بن موسى) الأثرية وغيرها من المخطوطات والوثائق.
القسم الثاني: يحتوي على بعض من مؤلفات أبناء الأسرة، وبعض من الكتب التي تحدَّثت عن الأسرة وعلمائها.